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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
08/03/2023 |
Data da última atualização: |
08/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CORTEZ, T.; MONTENEGRO, H.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; ANDRADE, S. C. S. |
Afiliação: |
THAINÁ CORTEZ, Universidade de São Paulo; HORÁCIO MONTENEGRO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo; LUIZ L. COUTINHO, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, Universidade de São Paulo; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; SÔNIA C. S. ANDRADE, Universidade de São Paulo. |
Título: |
Molecular evolution and signatures of selective pressures on Bos, focusing on the Nelore breed (Bos indicus). |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 17, n. 12, e0279091, 2022. |
Páginas: |
19 p. |
DOI: |
10.1371/journal.pone.0279091 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Evolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance of such traits from a domestication perspective. Our data provide new insights into how the genome may respond to intense artificial selection in distinct taxa, and reinforces the presence of selective pressures on traits potentially relevant for future animal breeding investments. MenosEvolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Amino acid biosynthesis; Genomic evolution of Bos species; Intense artificial selection in distinct taxa. |
Thesagro: |
Gado Nelore. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152197/1/MolecularEvolutionSignatures.pdf
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Marc: |
LEADER 02560naa a2200241 a 4500 001 2152197 005 2023-03-08 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/journal.pone.0279091$2DOI 100 1 $aCORTEZ, T. 245 $aMolecular evolution and signatures of selective pressures on Bos, focusing on the Nelore breed (Bos indicus).$h[electronic resource] 260 $c2022 300 $a19 p. 520 $aEvolutionary history leads to genome changes over time, especially for species that have experienced intense selective pressures over a short period. Here, we investigated the genomic evolution of Bos species by searching for potential selection signatures, focusing on Nelore, an economically relevant cattle breed in Brazil. We assessed the genomic processes determining the molecular evolution across Nelore and thirteen other related taxa by evaluating (i) amino acid sequence conservation, (ii) the dN/dS ratio, and (iii) gene families? turnover rate (lambda. Low conserved regions potentially associated with fatty acid metabolism seem to reflect differences in meat fat content in taxa with different evolutionary histories. All Bos species presented genes under positive selection, especially B. indicus and Nelore, which include transport protein cobalamin, glycolipid metabolism, and hormone signaling. These findings could be explained by constant selective pressures to obtain higher immune resistance and efficient metabolism. The gene contraction rate across the Nelore + B. indicus branch was almost nine times higher than that in other lineages (lambda = 0.01043 vs. 0.00121), indicating gene losses during the domestication process. Amino acid biosynthesis, reproductive and innate immune system-related pathways were associated with genes recognized within the most frequent rapidly evolving gene families and in genes under positive selection, supporting the substantial relevance of such traits from a domestication perspective. Our data provide new insights into how the genome may respond to intense artificial selection in distinct taxa, and reinforces the presence of selective pressures on traits potentially relevant for future animal breeding investments. 650 $aGado Nelore 653 $aAmino acid biosynthesis 653 $aGenomic evolution of Bos species 653 $aIntense artificial selection in distinct taxa 700 1 $aMONTENEGRO, H. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aANDRADE, S. C. S. 773 $tPlos One$gv. 17, n. 12, e0279091, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
04/09/2018 |
Data da última atualização: |
04/09/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
Nacional - A |
Autoria: |
MELO, A. C. F. L.; REIS, I. F.; BEVILAQUA, C. M. L.; VIEIRA, L. da S.; ECHEVARRIA, F. A. M.; MELO, L. M. |
Afiliação: |
Ana Carolina Fonseca Lindoso Melo, Pós-graduação - Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE; Iarle Feitosa Reis; Claudia Maria Leal Bevilaqua, UECe; Luiz da Silva Vieira, CNPC; Flávio Augusto Menezes Echevarria, EMBRAPA CPPSUL; Luciana Magalhães Melo. |
Título: |
Nematódeos resistentes a anti-helmíntico em rebanhos de ovinos e caprinos do estado do Ceará, Brasil. |
Ano de publicação: |
2003 |
Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, Santa Maria, v. 33, n. 2, p. 339-344, 2003. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Resumo: O controle do parasitismo por nematódeos gastrintestinais é feito basicamente com a utilização de anti-helmínticos. Falhas no controle são o primeiro sinal do aparecimento de resistência anti-helmíntica. A real situação da prevalência da resistência anti-helmíntica, em fazendas comerciais de criação de ovinos e caprinos no Brasil, é desconhecida. Esse experimento teve como objetivo, estimar a ocorrência de resistência ao oxfendazol, levamisol e ivermectina em propriedades comerciais de criação de ovinos e caprinos, na região do médio e baixo Jaguaribe, através do teste de redução na contagem de ovos nas fezes acompanhados de coproculturas. O trabalho foi realizado em 25 criações, sendo 16 de ovinos, 7 de caprinos e uma de ovinos e caprinos. Os dados obtidos foram analisados pelo programa estatístico RESO (1989). A prevalência de nematódeos resistentes ao oxfendazol, levamisol e ivermectina em ovinos foi de 88%, 41% e 59%, e em caprinos de 87,5%, 75% e 37,5%, respectivamente. Observou-se que o gênero Haemonchus foi o mais prevalente na população resistente a todos os anti-helmínticos, tanto em ovinos quanto em caprinos, seguido de Trichostrongylus e Oesophagostomum. [Nematodes resistant to anthelmintics in sheep and goat flock in the State of Ceará, Brazil]. ABSTRACT - The control of gastrointestinal nematodes parasitism is made basically with anthelmintics. Control failure is the first sign of anthelmintic resistance development. The actual situation of anthelmintic resistance prevalence in commercial farms of sheep and goats in Brazil is unknown. The aim of this work was to estimate the occurrence of oxfendazole, levamisole and ivermectin resistance in sheep and goats from medio and baixo Jaguaribe region by faecal egg count reduction followed by coprocultures. The work involved 25 farms (16 sheep farms, 7 goat farms and one of sheep and goats). Data were analysed by RESO (1989). The prevalence of resistant nematodes to oxfendazole, levamisole and ivermectin was respectively 88%, 41% and 59% in sheep and 87.5%, 75% and 37.5%, in goats. Haemonchus was the most prevalent genus in the resistant population to all anthelmintics in sheep and goats, followed by Trichostrongylus and Oesophagostomum. MenosResumo: O controle do parasitismo por nematódeos gastrintestinais é feito basicamente com a utilização de anti-helmínticos. Falhas no controle são o primeiro sinal do aparecimento de resistência anti-helmíntica. A real situação da prevalência da resistência anti-helmíntica, em fazendas comerciais de criação de ovinos e caprinos no Brasil, é desconhecida. Esse experimento teve como objetivo, estimar a ocorrência de resistência ao oxfendazol, levamisol e ivermectina em propriedades comerciais de criação de ovinos e caprinos, na região do médio e baixo Jaguaribe, através do teste de redução na contagem de ovos nas fezes acompanhados de coproculturas. O trabalho foi realizado em 25 criações, sendo 16 de ovinos, 7 de caprinos e uma de ovinos e caprinos. Os dados obtidos foram analisados pelo programa estatístico RESO (1989). A prevalência de nematódeos resistentes ao oxfendazol, levamisol e ivermectina em ovinos foi de 88%, 41% e 59%, e em caprinos de 87,5%, 75% e 37,5%, respectivamente. Observou-se que o gênero Haemonchus foi o mais prevalente na população resistente a todos os anti-helmínticos, tanto em ovinos quanto em caprinos, seguido de Trichostrongylus e Oesophagostomum. [Nematodes resistant to anthelmintics in sheep and goat flock in the State of Ceará, Brazil]. ABSTRACT - The control of gastrointestinal nematodes parasitism is made basically with anthelmintics. Control failure is the first sign of anthelmintic resistance development. The actual situation of anthelmintic ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Brasil; Ceará; Nematódeo gastrintestinal; Resistance to anthelmintics. |
Thesagro: |
Anti-helmíntico; Caprino; Helminto gastrintestinal; Nematóide; Ovino; Parasitologia; Resistência. |
Thesaurus NAL: |
Anthelmintics; Goats; Nematoda; Sheep. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/33198/1/API-Nematodeos-resistentes.pdf
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Marc: |
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